Straff- och arbetsfängelser och centralfängelser
Korrektionsinrättningarna och fästningarna upphörde år 1860 formellt som inrättningar för fångförvaring och en ny instruktion utfärdades för rikets straff- och arbetsfängelser. Mindre arbetsföra för lösdriveri dömda män förvarades också i straff- och arbetsfängelserna i Varberg (till 1877), på Långholmen (till 1880) och i Landskrona (till 1903).
Fängelserna i rikets fästningar förblev gemensamhetsfängelser ännu in på 1870-talet utan celler. För straff som översteg sex år förordades i debattskrift från 1840 det s.k. Auburnsystemet, som innebar att fångarna nattetid isolerades från varandra, medan de på dagarna arbetade tillsammans i stora salar där det skulle vara knäpptyst.
För Auburnsystemet krävdes en annan byggmetod än för Philadelphiasystemet. Cellerna placerades i en enda lång korridor med gallerförsedda dörrar till celler på endast tre kvadratmeter, genom att de endast skulle användas nattetid. Straff- och arbetsfängelser som byggdes för Auburnsystemet kom i Sverige att kallas centralfängelser.
Straffängelset i Varberg
I Varbergs fästning inrättades 1848 ett straffängelse för livstidsfångar. Som mest kunde det vistas runt 500 interner här samtidigt. Fångarna sysselsattes bland annat med stenhuggeri i stenbrottet nedanför fästningen. Fängelset lades ned 1881.
Straffängelset i Landskrona
Även i Landskrona slott gjordes stora byggnadsarbeten på 1860-talet. En fängelsebyggnad tillkom och slottets östra rundel byggdes om till cellfängelse.
Straffängelset i Karlskrona
I det nya straffängelset i Karlskrona som byggdes år 1866 inom den västligaste delen av flottans skeppsvarv för 300 fångar inrymdes dels 106 fångar från Karlskronas fästningsfängelse, dels 77 fångar från Nya Älvsborgs fästningsfängelse som då blev nedlagt.
Straff- och arbetsfängelserna i de fd spinnhusen
Tukthusen (spinnhuse), omvandlade till korrektionsinrättningar, i Stockholm (Långholmen och Norrmalm), Norrköping, Göteborg omvandlades 1860 till straff- och arbetsfängelser.
Centralfängelserna
Centralfängelser uppfördes inledningsvis som ersättare för korrektionsinrättningarna i Stockholm, Göteborg och Norrköping samt som ersättare för arbetsfängelset vid Malmö fästning.